(1)能高效地进行固液分离，将废水中生物单元的悬浮物、胶体物和微生物菌群存留于原水中，进一步能更好的生物分解，净水则从膜内分离出来。分离过程简单，占地面积小，出水水质好。一般不经三级处理即可重复使用。
(2)生物处理单元中的生物质可以保持高浓度，体积负荷大大增加。同时，膜分离的效率高大大缩短了处理单元的水力停留时间，生物反应器占用相应的面积减少。
(3)由于可以防止各种微生物菌群的流失，有利于生长缓慢的细菌（硝化细菌等）的生长，使系统中的各种代谢过程顺利进行。
(4)使一些难降解有机物的大分子停留时间更长，有利于它们的分解。